המבנה הוקם בשנת 1900 על ידי יעקב קנר שהיה ראש הוועד של המושבה ראשון לציון. במקצועו היה פחח אומנותי אך במושבה התמסר לעבודה חקלאית והיה בין הכורמים המצטיינים. בני הזוג הוריש את הבית למועצה המקומית
הערות:
משנת 1929 (שנת מות קנר) ועד הקמת המדינה הייתה פעילות נרחבת של ההגנה במקום. שימש גם כמפקדה של "ההגנה" והוטמן בו "סליק" במרתפו פעלו בית חולים וחדר ניתוח. משנת 1940 ועד 1985 שימש בית קנר כבית מגן דוד אדום, תחנת מכבי האש וגלריה עירונית לאמנות. בעבר השתמשו במרפסת הקדמית לייבוש שקדים בזכות תכנונה שיצר זרימת רוחות ואויר אליה.