בית המכס ותחנת המשאות נבנו בשנות השלושים כחלק ממתחם הרכבת החדש שכלל גם כמה מבנים, סככות ורציפים (בינהם סככת ההדרים). דרכו עברה הרכבת שתחנת המוצא שלה היתה ביפו (מתחם התחנה כיום). במסגרת תכנון מתחם הרכבת החדש הופרד איזור המשאות מאיזור נוסעים. לטובת האחרונים הוקמה תחנת רכבת הנוסעים בצידה המזרחי של דרך פתח תקוה
הערות:
בית המכס הוקם בצמוד לתחנת הרכבת שנקראה תחנת תל אביב ממנה יצאו רכבות לירושלים משנת 1920 (ראשית ימי המנדט הבריטי) ועד לשנת 1970. בשנים הראשונות (1917-1920) היו אלה רכבות משא צבאיות שעצרו בסמוך לצומת כשרות לתושבי הסביבה. הבריטים קראו לצומת Sarona Junction (צומת שרונה. לימים צומת הנפט) וזה גם היה שמה של תחנת הרכבת שהם הקימו בסמוך. אחר כך הוקמה במקום תחנת תל-אביב (אשר כונתה בהמשך תחנת בית הדר מפאת סמיכותה לבית הדר). את מסילת יפו - לוד פירק הצבא הטורקי בשנת 1915. (שולה וידריך)
