ארכיון "בית ראשונים" הוקם בשנת 1980 כאגף ממוזיאון "בית ראשונים" להנצחת ראשוני נס ציונה וספור ייסודה. מטרת הארכיון לשמר ולתעד באמצעות מסמכים ומוצגים את ההיסטוריה של המושבה שנוסדה בשנת 1882 ע"י אדם יחיד - ראובן לרר שמו.
הארכיון ממוקם בבנין היסטורי שהוקם בשנת 1907 במטרה לשמש כבית ספר, בית כנסת, בית עם, בית ועד המושבה ובית ההגנה. המבנה שוקם בנת 1977 ובו שוכן המוזיאון.
בארכיון ניתן למצוא מסמכים מאז יסוד המושבה וכן חפצים שהיו בשימוש מייסדיה. המסמכים כוללים אוסף תמונות מימים ראשונים של ועד המושבה, מכתבים יוצאים ונכנסים, אוסף תמונות מימים ראשונים, אוספים אישיים, עבודות מחקר, סיפורים על המשפחות הראשונות וראיונות עם ותיקים. כמו כן כולל הארכיון ספרים הנוגעים לעלייה הראשונה בכלל.
הארכיון ממוחשב בחלקו וניתן לראות מקצתו באתר "בית ראשונים" וכן עצי משפחה.
